简介
从组织和细胞中提取蛋白可能是蛋白质组研究中最关键的一步,因为这一步影响了蛋白的产率、生物活性和特定目的蛋白结构的完整性。因此,我们要注意蛋白提取条件的选择。主要目标是在破坏力最小、保持蛋白结构完整性的前提下,可重复地使细胞最大程度地裂解。
[澳] 理查德 J. 辛普森 (Richard J.Simpson) 主编 何大澄 主译来源:丁香实验
操作方法
方案1 哺乳动物组织的匀浆实验
要点:所有操作均在 0~4°C 进行。
1.从动物中取出组织后,修剪并去除脂类和结缔组织,然后放入预冷的匀浆缓冲液 A 中。
2.用切刀把洗好的组织切成小块(如 1cm 方块),或者把这些组织放在绞肉机上搅两次。
像肝脏、大脑、肾和心脏等组织很容易在韦林搅切器中破碎,但是骨骼肌和肺则很难,所以应在勻浆之前先用家用绞肉机来绞碎。许多纤维组织,比如哺乳动物
方案2 用于免疫沉淀的培养细胞的裂解实验
一、方法 A: 单层培养的细胞的裂解
1.去掉培养基,并用冷 PBS 洗细胞 2 次。
2.把培养瓶置于冰上。
3.100mm 的培养瓶(预冷至 4°C) 中加入 10ml 裂解缓冲液,裂解缓冲液的体积应根据培养瓶的大小来调整。
4.冰上孵育细胞 10~30 min(取决于所孵育的细胞系),并不时地摇动瓶子。
5.在冰上倾斜瓶子,使缓冲液流向一 边
方案3 用于免疫印迹的动物培养细胞、酵母和细菌的裂解实验
1.将1X107~5X107个细胞加到1ml含有100 mmol/L DDT的Laemmli样品缓冲液中。
2.由于DNA的释放,在Laemmli缓冲液中细胞裂解液变得很黏,克服黏性问题有2种方法:
(1)离心裂解液lOOOOOg,20 min,除去DNA;
(2)超声破碎裂解细胞,每次超声15?30s,共4次,每次之间将样品在冰上放置15s。
3.在95
方案4 氮舱减压法裂解培养细胞实验
注意:因为要产生高压,应在保护遮蔽物后进行操作。
1.确保出口关闭(但不要过紧),并把装置放入冰中预冷(如果有必要)。
2.准备要破碎的细胞或组织。
贴壁培养的细胞:用磷酸盐缓冲液(PBS)温和地洗细胞2?3次,用橡胶细胞刮刀,把细胞从培养器皿中刮到PBS溶液中。
非贴壁培养的细胞:400g离心10min,收集细胞,用PBS洗细胞2~3次。
方案5 细菌中重组蛋白的小量提取实验
1.室温离心 1min,从 1ml 培养物中收集细菌。
2.去除上清,用 1ml 预冷的 0.5%(体积分数)TritonX-100 重悬细菌细胞的沉淀物。
3.超声波处理悬浮液,3 个循环,每次 20s。超声间隙把细胞放在冰上冷却。
4.将悬浮液在小型离心机中离心 lmin。
5.在上清液中加入 Lammli 样品缓冲液(含有 100 mmol/L DT
方案6 细菌中重组蛋白的大量提取实验
1.4°C、3000 g 离心 15 min 收集细菌。
2.用裂解缓冲液洗细胞,除去残留的培养基。重复步骤1,离心收集洗过的细胞。
3.倒出上清,称沉淀的湿重。
4.每克细胞沉淀用约 3 ml 裂解缓冲液重悬,4°C 条件下搅动悬浮液 30 min。如果沉淀物在 30 min 后没有完全悬浮,用韦林搅切器低速混合悬浮液 1min。
5.加溶菌酶至终浓度
方案7 从包含体中溶解大肠杆菌重组蛋白实验
1.如实验方案6所述裂解细胞。
2.4°C 条件下23000 g离心细胞裂解液30 min。
3.倒出上清,测定沉淀的湿重。
4.用约 10倍体积的洗涤缓冲液重悬沉淀,室温搅动悬浮液lh。
5.4°C条件下23000 g 离心混合物30 min。
6.除去上清,并重悬沉淀。
7.重复4~5步骤3次以上(直到重组蛋白的纯度>80%,用分
方案8 酵母提取物的制备实验1.在微型离心机上离心 3 mm,以收集细胞。
2.去上清,用 PBS 重悬细胞,再离心 3 min。
3.去上清,估算细胞沉淀的体积,向细胞沉淀中加人 3 倍体积的冰浴裂解缓冲液,悬浮后置于冰上。
4.加入等体积的预冷玻璃珠。
5.剧烈振荡悬浮液 30s。
6.重复步骤5,并在相差显微镜下观察,直到大部分酵母细胞被裂解。
7.4°C 条件下在小型离心机中离心悬浮液 5 min,
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方案9 真核细胞结构组分的差异去垢剂分离法
一、细胞制备
1.在冰上预冷细胞培养物,然后用冰浴的盐溶液、PBS 或其他的非变性缓冲液洗 2~3 次。
保存 1 份洗涤缓冲液(贮存在-70°C) 以备将来进行样品校正,或用于酶、蛋白或 RNA 分析的对照材料。
2.选择下面合适的方法来处理悬浮液或单层培养物。
处理悬浮培养物:悬浮培养的细胞所需的 DDF 体积取决于细胞的湿重或细胞数量。
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